生物医学文章评论网站PubMed Commons 被NIH 叫停

因网站的参与度及使用率过低,美国国立卫生研究院(NIH)日前宣布停止PubMed Commons服务。

PubMed 是以MEDLINE为数据库来源的免费搜索引擎,提供生物医学方面的论文搜索以及摘要。而由NIH发起的PubMed Commons服务则允许读者就数据库中2800万经过同行评议(Peer Review)的文章发表评论。

通过PubMed在线发表文章

PubMed的核心文献为生物医学,同时也提供其他医学相关学科的资源。由于一些期刊只会将部分发表的文章同步更新在PubMed,研究人员可以选择自己将文章提交到PubMed数据库并进行在线发表。已经被期刊接受的文章可以通过PubMed Central (PMC)平台上传至互联网,具体的步骤是:

  • 作者将文章原稿(包括表格、数据和其他相关信息在内)以XML格式提交给PMC;
  • PMC的工作人员对提交的文件进行审核;
  • 文章被收录至PMC并发表在互联网。

所有提交给PMC 的文章都会收到一个专属的PMCID编码,这使文章在正式见诸网络前也可以被引用。需要注意的是,如果文章由NIH资助,则必须在投稿被接受的第一时间上传至PMC。由于不同的期刊对于网络发表的规定不尽相同,NIH已经在其官方网站增加了有关提交文章的指引条目。

关于PubMed Commons项目

PubMed Commons是美国国立卫生研究院(NIH)于2013年推出的一项试点项目,以互联网为基础鼓励学者对已发表的论文进行公开和高质量的讨论。项目的试运营原本只有两年,2015年NIH决定延长两年的试验时间。

自发布以来,PubMed Commons对评论者的实名制要求一直存在争议。一些学者认为评论实名制是一个重要的过滤器,有助于保证评论的质量,而相反意见则表示这一要求会抑制评论者的积极性。上线五年来,PubMed Commons上只有6,000篇文章收到了共计7,500 条评论。相较之下,允许匿名评论的PubPeer平台与PubMed Commons同年上线,却拥有超过5万4,000条评论。因此,除了可替代平台的增加,PubMed Commons本身的低参与度也是导致项目无法持续运作的重要原因。

PubMed Commons的句点

许多专家对PubMed Commons被叫停表现出失望和担忧。实名制的目的在于鼓励学者负责任地作出发表后同行评议(Post-publication Peer Review),发现并且指出错误的实验数据。而以PubPeer为代表的匿名评论平台主要迎合一些积极性高的小众用户,更多的医学研究人员并得不到关注和重视。

由于PubMed Commons服务的关闭,2 月 15 日之后平台将不再接受新的评论。此外,到 2018 年 3 月 2 日为止,用户只能查看 PubMed Commons 上现有的评论。在这之后,要查阅所有的评论都需要从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的网站下载。

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