在科学研究过程中，研究者在观察和记录的时候应该保持客观，并且要避免任何利益和偏见的冲突，用这种方式产生的结果才能够推广到更加广泛的人群上。但即使是这种方法在医疗保健和教育领域也并不能保证有效。
与传统的基于文献综述、提出假说的模式相比，以社区为基础的参与式研究（Community-based Participatory Research，CBPR）采用的是不同的方法：它把社区当作是研究的合作伙伴，而不仅仅是研究对象。在这种情况下，社区会充分参与到研究的各个方面，使得研究人员可以更好的了解影响社区的因素，同时还可以从社区的直接反馈中得到提出的问题的解决方案。
在医疗保健和教育领域，社区应该积极参与到研究课题中。但是这样的高级别参与在实际操作中面临着一些障碍：
首先是信任。在当地的社区中心发布普通公告是不大可能激发居民积极参与的，研究人员需要花时间向居民解释自己的意图，并且要耐心详细回答任何相关问题。
其次是激励因素。潜在的研究参与者在决定是否参与前可能都会问：这跟我有什么关系？我在里头可以起到什么作用？他们这么问并不是想得到一些礼品或者费用的报销，可能他们只是想证明是有机会可以帮助到社区的。对研究人员来说，需要做足够的准备来很好回到这些问题。
另外还有居民的能力限制。居民可能完全意识到他们社区的问题，但却没有足够的能力来解决这些问题。在社区为基础的参与式研究中，如果想让居民的直接参与得到良好的效果，就需要提供必需的技能培训来帮助居民有能力实施提出的解决方案。
此外，持续的支持也是个困难的过程。一般来说，如果能够实现长期的合作，同时在实施过程中持续提供支持，社区为基础的参与式研究最终一定是会成功的。但是在现实中，这种持续的支持会受到很多客观因素的限制。
社区为基础的参与式研究在逻辑上是没有问题的，但是具体实现的难度却很大。要想获得成功，研究人员就需要抛弃掉传统的一些研究方法，专注于解决具体的问题上，比如帮助社区权衡知识、资源和结果的分配等。
