科学文章的撰写与一般自传、小说和演讲稿是有非常大的不同的。虽然多数期刊的投稿说明中没有对作者排序有着明确的规定，但都明确禁止以下的两种情况，一是荣誉作者（没有作者资格却被列为作者）；二是代笔作者（有作者资格却未被列为作者）。这也是青年科研人员可能会遇到的但是又不知道怎么处理的两种情况。如果出现了这样的情况，不仅是对荣誉和代笔署名的不公平，而且也会带来潜在的团队成员之间的矛盾，给团队合作带来很大的破坏 [1]。
什么是荣誉作者（honorary author）？
荣誉作者是指没有显著地为某项科研工作提供有效帮助的署名作者。通常情况下，荣誉作者是研究实验室或项目的负责人，他们更多的是规划项目的进度以及提供经费上的帮助，但是在具体的科研上，则并没有实质性的参与，只是在宏观上有一定的了解。实际上，文章的作者更倾向于主动添加这类作者，因为这些荣誉作者在学术圈都已经有了比较高的声誉或者知名度。在作者列表中有这些人的存在会在一定程度上增加文章的录用率，而在文章发表之后也更容易引起其他人的关注。而从荣誉作者的角度上看，既然可以不劳而获得到一篇文章的署名权，也就应该承担一定的责任。比如如果该项研究有被指出问题的话，他们也需要担当相关的责任。从权利跟义务上来说，这个是很合理的。所以那些给挂名的院士用自己没有看过文章来给造假文章推脱自己的责任是很不靠谱的。
那什么又是代笔作者（ghost author）呢？代笔作者则是相反的情况，那些为研究论文提供了显著帮助的人却未被列入名单的作者。比如有些人写作水平就是很高，但做科研就不行。所以他对文章的贡献仅限于写文章，但是没有具体的科研贡献。文章不是要按照科研的贡献来排吗？所以他就排除在作者列表之外。这也就是代笔作者的由来。除了只负责写作的“科研人员”，学生跟技术人员也通常会被省略掉，没有被加入到作者列表中。
Annette Flanagin在1998年发表了一篇文章”Prevalence of Articles With Honorary Authors and Ghost Authors in Peer-Reviewed Medical Journals” [2]。文章分析了6个国际顶级医学期刊（Annals of Internal Medicine, JAMA, and The New England Journal of Medicine, American Journal of Cardiology, American Journal of Medicine, and American Journal of Obstetrics and Gynecology）1996年809名通讯作者，结果显示19％（11％〜25％）的论文有“荣誉作者”，11％（7％〜16％）的论文有“代笔作者”，2％ 的论文同时存在“代笔作者”和“荣誉作者”。由此可见，文章的署名不当情况是很常见的，或者大家都已经习以为常了，对具体情况都可以有“合理”的理由来解释。但是长此以往，总是会对科研文章的发表带来更大的负面效应。
现在有一些期刊和机构已经开始实行严格的措施来以防止对作者著作权的侵犯。比如一些学校明确说明除了前4个作者，其他作者一概不计入文章的有效贡献。如果需要被计入的话，就要写一个文档，清楚说明其他作者的具体贡献。还有Nature杂志在作者投稿时清晰规定每个作者分别陈述对科研的贡献和分工，以确保文章的署名是正确的。
[1] http://www.cjebm.org.cn/Upload/PaperUpLoad/61aa8328-6c59-4a57-bd42-d5836411b0f1.pdf
[2] http://faculty.ksu.edu.sa/hazzaa/Resources/Ghost%20Authors%20-%20JAMA%2098.pdf
