科学研究是个复杂的探索未知的过程，从最初的设想到最后成功实现，期间要经历很多次的发现错误、改正错误的循环。作为科学研究，100% 的成功率是不存在，50% 的成功率都算是高的了。因为某些客观原因使得研究过程或结果存在缺陷几乎是不可避免的，这并不属于故意的研究欺诈行为，也是可以堂堂正正写在论文里分析原因的。而实际情况却是，愿意把自己研究缺陷或局限性写进论文的少之又少。究其原因，也许还是因为大部分都还是不喜欢缺陷的吧。而且一旦已经知道了缺陷的原因，就有机会进行改正而变成一个成功的文章了。
科学研究的缺陷一般可以概括为以下几方面：
- 由于研究对象的复杂性，在实验设计时考虑的不够全面，使得实际情况没有完全按照预期设计走。
- 由于研究经费、实验设备等条件限制，使得实验不够全面，不够精细或不够深入。
- 由于研究团队缺乏经验，在实验操作操作过程中存在某些失误。
- 由于样本数量有限或数据分析方法存在问题，使得观点或结论不够全面。
一般来说研究的缺陷可以在论文的 “ 分析与讨论 ” 这一章中写出来，并分析原因，进而提出需要进一步解决的问题。这对促进科学研究是具有积极作用的。如果科研人员敢于客观地在论文中表达自己研究的不足之处，那么审稿人不但不会因为这些缺陷来否定你的研究，反而会欣赏你严谨的学术态度。而实际上在写文章的时候，对于研究中的缺陷，大多数人会主动选择不去提起，或者避重就轻地写一些套话，真正存在的问题很少拿出来分析。
科学发展的过程是允许有缺陷的研究存在的，但我们也不能把这个当做“马虎”或者“赶进度”研究的一个借口。总不能说一个错误百出，到处都是漏洞的研究可以理直气壮的存在吧。考虑不周全的地方总会有的，但是科学的严谨性正是要让这些不周全的地方越变越少的。
